Tüm Yazılar

Bilgisayar tabanlı moleküler dinamik (MD) simülasyonları, klasik hareket kurallarını kullanarak biyolojik sistemlerde yer alan atom ve moleküllerin zaman içerisindeki hareketlerini inceler. 1950'lerden beri moleküler simülasyonlar; yoğun madde sistemlerindeki sorunları çözmek çözmek amacıyla kullanılmaktadır.

Potansiyel bir ilaç adayının vücutta nasıl davranacağını, hedef bölgeye yeterli konsantrasyonda ulaşıp ulaşamayacağını ve ne kadar süre biyoaktif formda kalacağını anlamak, başarılı bir ilaç geliştirme sürecinin temel taşlarından biridir. ADMET analizi, bu değerlendirmelerin sistematik olarak yapılmasını sağlayan bir yaklaşımdır ve erken aşamada fiziksel örneklere erişimin sınırlı olduğu durumlarda in silico modeller geçerli alternatifler sunmaktadır.

Genomik veri analizi, biyolojik araştırmalarda devrim yaratan yeni nesil dizileme (NGS) teknolojilerinin ürettiği muazzam veriyi anlamlandırmak için kullanılan yöntem ve araçların bütününü ifade etmektedir. Genomik veri; DNA dizileri, RNA transkriptleri, metagenomik örnekler ve epigenetik modifikasyonlar gibi geniş bir yelpazedeki bilgileri kapsar.

SwissTargetPrediction, 2014'ten beri çevrimiçi olan ve küçük moleküllerin en olası protein hedeflerini tahmin etmeyi amaçlayan bir web aracıdır. Tahminler, tersine tarama yoluyla benzerlik prensibine dayanmaktadır.

Modern kuantum kimyasının nihai hedeflerinden biri, atom ve moleküllerin elektronik yapısını ve özelliklerini temel fiziksel prensiplerden yola çıkarak tanımlayan Schrödinger denklemini çözmektir. Bu ab initio yaklaşım, deneysel verilere dayanmadan teorik öngörülerde bulunma gücü sunmaktadır.