ORCA Programı için Kurulum Rehberi

ORCA, Prof. Frank Neese'nin grubu tarafından geliştirilen güçlü ve çok yönlü bir kuantum kimyası yazılım paketidir. ORCA programı akademik kullanım için ücretsizdir.

1.Adım:  https://www.faccts.de/orca/ adresine gidilir. Burada “DOWNLOADS” sekmesine girilir. Açılan pencerede ORCA web sitesine akademik mail ile kaydolunur. Daha sonra akademik maile gelen link ile birlikte kayıt tamamlanır ve tekrardan web siteye mail adresi ve şifre ile giriş yapılır.

Şekil 1. ORCA İndirme Ekranı.

Bu indirme sayfasında sırasıyla Mac, Linux ve Windows işletim sistemleri için farklı ORCA sürümleri görünmektedir. “...macosx_intel_openmpi411” ile sona eren dosya macOS kullanan Intel işlemcili Mac'ler için OpenMPI 4.1.1 kütüphanesi içeren sürümü, “...macosx_arm64_openmpi411” ise macOS ARM Apple M1/M2/M3 işlemcili Mac'ler için optimize edilmiş olan sürümü, “...linux_arm64_shared…” ise Linux ARM tabanlı Linux sunucular için (örn: AWS Graviton) olan sürümü, “...linux_x86-64_...nodmrg” olan dosya ise Linux  x86_64 işletim sistemine sahip standart Linux sunucular için olan dosya sürümünü belirtmektedir.

Burada "nodmrg" eki, DMRG modülünün dahil olmadığını belirtir. Orca...Win64_msmpi.zip ile başlayan dosya Windows x86_64 Standart Windows kurulumunu içeren dosyadır ve Microsoft MPI (paralel hesaplama) destekler. Orca...Win64_autoci.zip dosyası ise Windows işletim sistemine uygun olup AutoCI modülünü içerir. Bu modül çok büyüktür ve karmaşık kuantum kimyasal hesaplamalar için ek veriler içermektedir ve bundan dolayı boyutu (7.3 GB) çok yüksektir.

SHA256 dosyaların orijinalliğini belirten bir koddur.

2.Adım:

Windows için ORCA kurulumu

Windows için ORCA kurulumu yapmak için “Orca...Win64_msmpi.zip” ile başlayan dosya indirilir. Zip dosyası Winrar ya da başka sıkıştırma programı kullanılarak bir klasöre çıkarılır. Ardından Orca6.1.0.Win64.exe'ye çift tıklanır. Daha sonra ilgili adımlar standart program kurulumu gibi devam eder. Tipik bir kurulumda yalnızca ORCA'nın seri modülleri kopyalanır. ORCA'nın paralel bölümünü de kurmak için Özel veya Tam kurulum seçeneğini kullanılır. ORCA'nın varsayılan dizini C:\Orca_6.1.0'dır ancak gerekirse farklı bir klasör seçilebilir. Gerekli ortam değişkenleri buna göre ayarlanmaktadır.

Linux için ORCA Kurulumu

Linux için ORCA dosyasını indirilir. Arşivi “tar -xf dosya_adi.tar.xz” komutu ile çıkarılır, dizin "orca" olarak yeniden adlandırılır ve klasör kullanıcı ana klasörüne (~) taşınır. Daha sonra klasörün içerisine girerek dosya_adı.run gibi bir .run dosyası görünmelidir. chmod a+x dosya_adı.run komutu ile çalıştırılabilir linux dosyasını terminalde çalıştırmak için yönetici izni verilir. Daha sonra ./dosya_adı.run komutu ile dosya terminal üzerinde çalıştırılır. Kurulum programı, ORCA'yı kullanıcı dizinine kuracak ve ORCA dizinini içerecek şekilde yolu ayarlayacaktır. Kurulum programında sadece çıkarma, çıkarılacak yolu interaktif ya da normal olarak belirleme gibi seçenekler de bulunmaktadır.

 -i        : İnteraktif olarak başka bir kurulum yolu belirt

  -p <path> : Başka bir kurulum yolu belirt

  -x        :Sadece çıkart

Örnek kullanım:

./dosya_adı.run -- -p /my/home/orca/dir

ORCA yüklendikten sonra programı PATH değişkenine eklemek için:

> echo 'export PATH="$HOME/orca:$PATH"; export LD_LIBRARY_PATH="$HOME/orca:$LD_LIBRARY_PATH"'  >> ~/.bash_profile; source

> ~/.bash_profile

Kodu terminale yazılır. Bu kodda $HOME/orca ORCA’nın yüklü olduğu klasör yolunu belirtmelidir. Kod basitçe programın yüklü olduğu klasörü ve kütüphane yolunu PATH değişkenine atar.

Mac için ORCA Kurulum

MacOS için ORCA kurulumu Linux’taki kuruluma benzemektedir. Linux’daki gibi .run dosyası çalıştırılır ve PATH değişkeni atanır.

Terminale:

echo 'export PATH="/Applications/orca:$PATH"; export LD_LIBRARY_PATH="/Applications/orca:$LD_LIBRARY_PATH"'  >> ~/.zshrc; source ~/.zshrc

kodu yazılır.